A Linha 3 examina as dinâmicas de poder nas metrópoles brasileiras e busca subsidiar a construção de sistemas de governança capazes de promover justiça social, cooperação interfederativa e participação democrática. A linha investiga temas como os ilegalismos, o controle territorial armado e seus impactos na produção do espaço urbano, bem como os processos de desregulação urbanística e ambiental.
Também analisa os efeitos das políticas neoliberais e do contexto político recente sobre o orçamento público, os planos diretores e as políticas ambientais, além de explorar as implicações da digitalização do espaço urbano e do chamado capitalismo algorítmico. Por fim, avalia a capacidade fiscal dos municípios e seus condicionantes institucionais, com vistas a fortalecer a integração de políticas públicas e a gestão democrática das metrópoles.